Zákon zakotvuje, že na súdoch by mal pôsobiť len jeden predseda a jeden podpredseda. V súčasnosti majú súdy podpredsedov dvoch alebo troch. V návrhu zákona, ktorý počíta s účinnosťou najskôr od 1. januára 2005, je stanovené dvojročné prechodné obdobie.
Zmeniť by sa mal podľa návrhu zákona aj spôsob ustanovenia predsedov súdov. V súčasnosti ich do funkcie menuje i odvoláva minister spravodlivosti. Po novom by sa na tento post malo uskutočniť výberové konanie a z troch najúspešnejších účastníkov by mal minister vybrať jedného, ktorého do funkcie vymenuje.
Zásadné zmeny by mali nastať aj v správe súdov. Návrh zákona posilňuje kompetencie riaditeľov správy súdov, na ktorých by sa mala preniesť zodpovednosť za hospodárenie a finančné otázky. Odľahčia sa tým predsedovia súdov, ktorí by sa mali venovať hlavne riadeniu výkonu súdnictva. V súčasnosti je zodpovednosť za celé riadenie súdu na predsedovi, ktorý musí podpísať každú faktúru.
Podľa návrhu zákona by sa mala sudcovská samospráva rozšíriť aj na okresné súdy, kde vzniknú sudcovské rady. Dnes majú tieto orgány len krajské súdy a Najvyšší súd. Na všetkých všeobecných súdoch by tiež mali vzniknúť odborné skupiny zložené z odborníkov na konkrétne právne oblasti. Na okresných súdoch by to mali byť grémia, na krajských kolégia.
