V druhej voľbe poslanci rozhodovali medzi kandidátkami Mariannou Mochnáčovou a Annou Zachovou. Zo 120 prítomných Mochnáčovú podporilo 53 poslancov, za Zachovú hlasovalo 15 prítomných. Na zvolenie kandidáta bola potrebná podpora nadpolovičnej väčšiny prítomných.
Mochnáčovú navrhla Právnická fakulta Univerzity Mateja Bela v Banskej Bystrici a Zachovú klub poslancov Ľ-HZDS. Národná rada SR na májovej schôdzi zvolila troch kandidátov - podpredsedu trestného úseku bratislavského krajského súdu Tibora Kubíka, právničky Darinu Ličkovú a Ivettu Marušákovú.
Sudcovia Ústavného súdu SR Ján Klučka a Daniel Šváby sa 26. apríla 2004 vzdali funkcie sudcov Ústavného súdu SR, ktorá im podľa Ústavy SR zanikla 30. apríla 2004. NR SR podľa ústavy navrhuje prezidentovi dvojnásobný počet kandidátov na sudcov ÚS SR, ktorých má vymenovať, to znamená štyroch.