Ako sa uvádza v Zhodnotení systému pripomienkového konania a návrhoch na jeho zlepšenie, so skracovaním lehôt súvisia aj ďalšie negatívne javy. Ide o neskoré zverejňovanie materiálov na internete a zaratúvanie dní pracovného voľna do času na pripomienkovanie. Osobitným problémom sa podľa ministerstva ukazuje tzv. konferenčné pripomienkové konanie. Je to pripomienkovanie, ktoré sa koná v jeden deň so všetkými pripomienkujúcimi subjektmi. Predkladateľ zvolá zástupcov všetkých pripomienkujúcich subjektov a za ich účasti sa prerokúva bod po bode s tým, že pripomienky sa uplatňujú ústne, resp. ak je materiál zaslaný v predstihu, tak aj písomne. "Takáto forma je absolútne neprijateľná a vo svojej podstate znemožňuje riadne posúdiť predkladaný návrh," konštatuje ministerstvo spravodlivosti.
K skráteniu reálneho času na pripomienkovanie prispievajú aj technické problémy pri používaní internetu a elektronickej pošty. V prípade viacdňovej nedostupnosti materiálu na pripomienkovanie na internete sa pripomienkujúce organizácie dostávajú do časového stresu, čím podľa ministerstva klesá kvalita pripomienok a kvalita konečného výsledku celého materiálu.
