Ako povedal v diskusnej relácii televízie Joj Sedmička zmluva nadraďuje právo na výhradu vo svedomí nad iné práva garantované ústavou, ako sú právo na život, zdravie alebo vzdelanie. Jej prijatie by podľa Malchárka negatívne postihlo hlavne obyvateľov malých miest a dedín, pretože v regiónoch by obmedzilo poskytovanie viacerých služieb.
„Toto hovorili komunisti kresťanom štyridsať rokov, to je proste svinstvo“, reagoval podpredseda KDH a minister vnútra Vladimír Palko. Výhrady ANO k zmluve prirovnal k proticirkevnej činnosti komunistickej tajnej služby. „Čo robila Štb proti cirkvi, to niečo podobného, v podobnom duchu dnes robí ANO a televízia Markíza“, vyhlásil Palko. Rovnako zásadne odmietol aj požiadavku aliancie na súpis cirkevného majetku. Návrh označil za „slizký“, pretože vyvoláva voči cirkvi negatívne pocity. Podľa Palka na audit cirkevného majetku v súčasnosti neexistujú relevantné dôvody.
Napriek programovým aj osobnostným rozporom nevníma Palko vzťahy medzi KDH a ANO dramaticky. ANO sa podľa neho usiluje o „politickú záchranu“, preto sa snaží ideologicky profilovať proti KDH. Správanie svojho koaličného partnera však označil za nemorálne.