Podľa Juraja Švajdu zo Správy TANAP-u by prijatie zákona znefunkčnilo činnosť správ chránených území a znížilo kvalitu ochrany prírody.
Doteraz boli profesionálni strážcovia pôsobiaci v jednotlivých národných parkoch riadení priamo šéfmi správ týchto parkov. Navrhovaný presun tejto právomoci pod vzdialené Krajské úrady životného prostredia by podľa Švajdu znamenal horšie zohľadňovania potrieb chráneného územia.
Do pripravovanej stráže prírody SR nie je začlenená lesná a poľovná stráž. Tieto zložky, ktoré sú v kompetencii rezortu pôdohospodárstva, majú na ochrane prírody veľký podiel, preto je podľa Švajdu nelogické, aby v nej neboli integrované.
Správa TANAP-u kritizuje aj poddimenzovaný odhad potreby finančného a materiálneho zabezpečenie činnosti strážcov, či dôraz na ich represívne právomoci.
Zákon o stráži prírody SR pripravil rezort životného prostredia. Od nového roku chce existujúcu rybnú stráž, vodnú stráž a stráž prírody zlúčiť do jedinej stráže prírody Slovenskej republiky.
Ministerstvu sa nepáčilo, že súčasné stráže majú rôznych zriaďovateľov, obvody pôsobnosti, rôzne vybavenie a zabezpečenie a že sa nemôžu vzájomne zastupovať. Vytvorením nového právneho predpisu chce zlúčiť a rozšíriť pôvodné oprávnenia a povinnosti jednotlivých stráží v novej podobe. Stráž prírody SR by zriaďovali krajské úrady životného prostredia, ktoré by určovali aj ich územnú pôsobnosť. Počet profesionálnych strážcov životného prostredia by mal do roku 2010 vzrásť zo súčasných 119 na 511 osôb, náklady na ich pôsobenie z osemnástich na 93 miliónov korún. Okrem profesionálnych strážcov chráni v súčasnosti slovenskú prírodu aj 3 753 dobrovoľných strážnikov. Nový zákon navrhuje tento počet i ročné náklady, približne tisíc korún na osobu, ponechať.
Strážcovia zákonov o prírode budú môcť na chránenom území okrem iného zastaviť a kontrolovať autá a prehliadať ich obsah, zisťovať totožnosť osoby, prípadne ju predviesť na políciu. Pri výkone povinností budú môcť použiť donucovacie prostriedky, napríklad slzný plyn, obušok, putá či služobného psa, vo výnimočných prípadoch zbraň.
