Vitrážny oltár z roku 1867 reprezentuje jedinečný architektonický skvost v európskom meradle. Pozoruhodný je najmä dekoráciou z 50 000 brúsených farebných perál a korálikov z krištáľového skla. Hlavným vizuálnym a kompozičným motívom je socha umučeného Krista. Miesto vzniku oltára sa dosiaľ nepodarilo zistiť, no pôvod farebných sklíčok určili do dobových sklárskych dielní v Nemecku a Česku.
Pôvodný oltár bol značne zdevastovaný po necitlivých stavebných zásahoch v polovici minulého storočia. Celkový vzhľad značne poškodil aj požiar v sakristii a zadymenie nevhodným osvetlením zo sviečok a olejových kahancov.
Hlavným reštaurátorom oltára bol akademický sochár Ladislav Čerba. Prostriedky na rekonštrukciu vo výške 1,5 milióna Sk sa získali zo sponzorských darov a verejných zbierok. Na vysvätení vzácnej cirkevnej i kultúrnej pamiatky sa okrem veriacich, početných hostí zúčastnili aj podpredseda vlády SR Pál Csáky a predseda Bratislavského samosprávneho kraja Ľubo Roman.
