Zdravotníci zaznamenali 33 372 akútnych respiračných ochorení, čo je chorobnosť 621,7 na 100 000 obyvateľov. V druhom týždni roka 2006 bolo 29 016 ochorení. Podľa zastupujúcej hlavnej hygieničky SR Dariny Lopušnej však chorobnosť naďalej zostáva pod očakávanou úrovňou. Výskyt chrípky stúpol u všetkých vekových skupín, najviac sa rozšírila u detí predškolského veku a školákov od šesť do 14 rokov. Komplikácie vznikli u 6,3 percent chorých. Najčastejšie mali pacienti zápaly priedušiek a pľúc.
V laboratóriu Národného referenčného centra (NRC) pre chrípku v ÚVZ SR Bratislava prvýkrát v tejto chrípkovej sezóne izolovali vírus chrípky typu B identifikovaný ako B/Malaysia/2506-2004-like. Našli ho u 16 ročného dievčaťa z Bratislavy, ktoré ochorelo vo štvrtok 12. januára. Očkovacia látka určená na očkovanie pre túto chrípkovú sezónu obsahuje odporúčaný vírus chrípky B/Shangai/361/2002-like. Identifikovaný vírus je veľmi podobný vakcinálnemu kmeňu. V NRC celkovo vyšetrili počas tretieho týždňa štyri nazofaryngeálne výtery, od začiatku sezóny prijali 92 výterov.
Aktivita chrípky v Európe je podľa Lopušnej pod úrovňou očakávanej chorobnosti. Sporadický výskyt chrípky hlásilo 15 krajín, aktívna nie je u 11 krajín zapojených do Európskej siete EISS. V tejto chrípkovej sezóne v Európe dominujú vírusy chrípky typu B, je ich 64 percent.