Podľa ochranárov mali platby kompenzovať poľnohospodárom dodatočné náklady a straty príjmu pre obmedzenia hospodárenia na pozemkoch zaradených do európskej sústavy chránených území Natura 2000. Zástupcovia ochranárskych organizácií podporujú tieto platby preto, lebo pomôžu poľnohospodárom, lesníkom aj životnému prostrediu.
MP SR zdôvodňuje svoj postup tým, že kompenzácia vlastníkov a užívateľov je v kompetencii Ministerstva životného prostredia (MŽP) SR. Európska únia však podľa ochranárov nevytvorila samostatný fond pre ochranu prírody, ale určila, že financie na kompenzáciu obmedzení v územiach Natura 2000 je možné čerpať len z Európskeho poľnohospodárskeho fondu pre rozvoj vidieka. Prostriedky tohto fondu budú na Slovensku rozdeľované prostredníctvom plánu a programu, ktoré pripravuje MP SR.
"Za prípravu finančného nástroja z fondov EÚ na kompenzáciu obmedzení v územiach Natura 2000 je tak plne zodpovedné MP SR," tvrdia ochranári. Ak Slovensko podľa nich nevyužije možnosť zabezpečiť financie na náhrady z prostriedkov EÚ, bude ich musieť hľadať v štátnom rozpočte, ktorý s tým však nepočíta.
