Župani, väčšinou zvolení za stranu Smer-SD premiéra Roberta Fica, však už skôr obvinili z nepripravenosti na čerpanie eurofondov ministerstvo výstavby. Prípravu úradníkov krajov navyše podľa nich brzdí Janušekov úrad.
"Je to nepripravenosť, nie sú vybavení, nevedia to, nie je tam záruka, aby to bolo dobre spravené," vymenoval Janušek dôvody, prečo podľa neho zatiaľ župy peniaze z EÚ deliť nemôžu. Úradníkov samosprávnych krajov podľa neho najprv musia odborníci z ministerstva vyškoliť. Kedy by mali byť vyškolení, nevedel Janušek povedať. Krajom navyše vytkol, že sú rozlohou aj počtom obyvateľov príliš malé na to, aby mohli rozhodovať o zdrojoch z EÚ.
Nezhody medzi županmi a ministerstvom by sa podľa Janušeka nemali negatívne odraziť na spolupráci troch vládnych strán. Župani totiž v minulosti vyhlásili, že za neochotou ministerstva vzdať sa právomocí pri delení eurofondov stojí SNS. Naznačili, že strana Jána Slotu by si tak chcela udržať vplyv nad miliardami korún, ktoré v rokoch 2007 až 2013 môže Slovensko získať.
"Toto boli dohody ešte pred vytvorením vlády, že toto ministerstvo bude pod kuratelou SNS," reagoval Janušek. Ministerstvo podľa neho nesie za čerpanie financií z EÚ zodpovednosť, a preto ho nezverí nedostatočne pripraveným krajom.
Samosprávne kraje Janušekovu kritiku odmietli a naopak tvrdia, že prípravu ich úradníkov zastavilo práve ministerstvo výstavby. Zatiaľ sa totiž nikto neškolí, potvrdili ČTK zástupcovia Nitrianskeho a Žilinského samosprávneho kraja. "Sme pripravení, avšak certifikácia, ktorú vykonáva ministerstvo financií, závisí od podpísania dohody s ministerstvom výstavby ako riadiacim orgánom," povedal hovorca Žilinského samosprávneho kraja Peter Kubica. Kraje odmietli aj argument, že sú príliš malé. Nielen v susednom Česku či Rakúsku, ale aj v ďalších krajinách sú aj menšie regióny, ako slovenské vyššie územné celky, dodal Kubica. Napriek tomu podľa neho eurofondy medzi žiadateľov rozdeľujú.
Cestu k samotnému čerpaniu eurofondov by mal otvoriť Národný strategický referenčný rámec. Ide o súhrn všetkých aktivít a peňazí, ktoré budú na ich plnenie potrebné. Minister dnes informoval, že úrady v centrále EÚ by strategický rámec s veľkou pravdepodobnosťou mali schváliť v auguste.
Janušek taktiež potvrdil zámer posilniť právomoci štátu na úkor súkromných vlastníkov pri vyvlastňovaní území, kadiaľ by mali viesť napríklad diaľnice. Budovanie niekoľkých úsekov slovenských diaľnic totiž zablokovali nespokojní vlastníci, ktorí nesúhlasili s cenou, za akú chcel od nich štát pozemky pod budúcimi diaľnicami odkúpiť. Podľa ministra tým nebudú narušené ústavné práva vlastníkov, pretože podobným spôsobom sa podľa neho pozemky vyvlastňujú aj v iných štátoch.