V zriaďovateľskej pôsobnosti Mestského úradu sú tri ZŠ, v meste majú aj cirkevnú ZŠ Mansvéta Olšovského a špeciálnu ZŠ patriacu Krajskému úradu v Bratislave. V ich laviciach bude sedieť 2079 žiakov, z toho 206 prvákov. Mesto je tiež zriaďovateľom MŠ so štyrmi elokovanými triedami, do ktorých bude chodiť 500 detí. Základná umelecká škola očakáva 610 žiakov a Centrum voľného času vyše 500.
Dve malacké gymnáziá sa pripravili na nástup 817 študentov. Prvákov ešte čaká slávnostné otvorenie školského roka. V stredu sa im v nedávno rekonštruovanom Kultúrnom domečku kine prihovorí primátor Jozef Ondrejka, pozrú si film Shrek 3 a dostanú malé darčeky od mesta. Podľa Alexandry Hrnkovej z malackého školského úradu v tomto meste pracuje 270 pedagogických zamestnancov.
Cez uplynulé prázdniny sa vo všetkých školách a školských zariadeniach robila bežná prázdninová údržba - maľovanie priestorov, oprava a dokúpenie nábytku. V MŠ pribudli záhradné atrakcie na školských dvoroch - šplhacia stena, padací most a hojdačky. ZŠ na Štúrovej ulici rekonštruovala dve triedy na odborné učebne a buduje volejbalové ihrisko, ZŠ na ulici Dr. Dérera začala s rekonštrukciou budovy školskej jedálne a školského klubu. Financie vo výške 5,3 milióna Sk sú z ministerstva školstva na riešenie havarijného stavu. Telocvičňa ZŠ na Záhoráckej ulici má novú palubovku v hodnote 170.000 Sk z vlastných zdrojov a grantu. Gymnázium na Ulici 1. mája rekonštruovalo a zateplilo strechu telocvične.