
Po novembri 1989 sa stal poradcom podpredsedu federálnej vlády pre legislatívu. Vo voľbách v roku 1990 bol zvolený za poslanca Federálneho zhromaždenia (FZ) ČSFR a stal sa predsedom branno-bezpečnostného výboru Snemovne ľudu FZ. Vo voľbách v roku 1992 bol opäť zvolený za poslanca Federálneho zhromaždenia.
V roku 1992 bol ministrom spravodlivosti SR. V roku 1994 bol podpredsedom vlády SR pre legislatívu vo vláde Jozefa Moravčíka. V rokoch 1994-98 bol poslancom Národnej rady (NR) SR.
Ivan Šimko bol zakladateľom Kresťanskodemokratického hnutia (KDH). V rokoch 1992-97 bol jeho podpredsedom. V parlamentných voľbách 1998 bol zvolený za poslanca NR SR (SDK), bol členom Ústavnoprávneho výboru NR SR. Patrí medzi 11 signatárov vzniku Slovenskej demokratickej a kresťanskej únie (SDKÚ). Na ustanovujúcom kongrese v novembri 2000 v Bratislave sa stal jej generálnym sekretárom. V máji 2001 bol vymenovaný do funkcie ministra vnútra SR.
V parlamentných voľbách 2002 bol zvolený za poslanca za SDKÚ.
Ivan Šimko je ženatý, má štyri deti.